在41年的退休生涯里，他把主要精力放在慈善事业上。当洛克菲勒开始考虑如何把巨额财产捐给别人时，几乎没有人愿意接受，说那是肮脏的钱。通过他的努力，人们最终慢慢地相信了他的诚意，并接受了他的好意：
密歇根湖畔一家学校因资不抵债行将倒闭，洛克菲勒马上捐出数百万美元，从而促成了如今的芝加哥大学的诞生；当时的美国没有医疗研究中心，他捐资20万美元成立了洛克菲勒医学研究所，后来这个研究所因为卓越成就获得了12项诺贝尔奖，比任何同类研究所所获奖项都多；此外，洛克菲勒还创办了不少福利事业以帮助黑人。
从19世纪90年代开始，他每年的捐献都超过100万美元。1913年，他设立了“洛克菲勒基金会”，专门负责捐款工作。他捐款总额达5亿美元之多！得到帮助的人开始感谢他，尊敬他。从这以后，人们开始以另一种眼光来看他。
哈佛金言：
洛克菲勒为了得到金钱而被世人唾弃，用金钱行善而得到人们尊敬的经历再次证明了金钱的两面性。但是，如果他没有反省自己的话，显然不会获得令人敬仰的人生，那样就会让自己的人生变成一个败笔。
